Семнадцатилетняя Акира Минамото живёт обычной жизнью токийской школьницы, пока странная мелодия в её телефоне не превращает прохожих в призрачных воинов. Оказывается, она является последней наследницей древнего клана ниндзя Касуми, а таинственный трек содержит цифровую версию забытых боевых техник.
Однако за этим стоит корпорация "Мизухо Технолоджис", которая похищает духовные артефакты и превращает их в коммерческие товары. В центре заговора находится дух мастера ниндзя Такеши Касуми, запертого полтора века назад в цифровой тюрьме.
Чтобы освободить своего наставника и защитить древние традиции, Акире предстоит собрать четыре священных свитка, разбросанных по всей Японии. Но её путешествие выйдет далеко за пределы родной страны — в Корею, где безумный учёный стремится воссоединить разделённый народ через мир мёртвых, и в Китай, где цифровые императоры планируют восстановить Поднебесную империю.